以實驗室內部為集成范圍,信息集成的工作主要集中在LIMS與各種分析儀器之間的集成,也就是LIMS的集成。從LIMS的定義來看,儀器數(shù)據(jù)的自動采集,即儀器連接,是LIMS系統(tǒng)中十分重要的模塊,也是用戶衡量LIMS實施成功與否的一個重要指標。下面就跟譜標小編一起來詳細看看吧~
將儀器連接到LIMS的好處是顯而易見的。讓儀器進入LIMS的集成后,由分析儀器到LIMS的自動數(shù)據(jù)傳輸將代替測試和質量控制結果數(shù)據(jù)的鍵盤輸入,從而避免了手工模式下的撰抄錯誤。數(shù)據(jù)自動傳輸通常是通過LIMS對數(shù)據(jù)文件的讀取來完成的,數(shù)據(jù)文件通常存放在LIMS所跟蹤掃描的某個目錄,它是以特定的格式來組織和傳輸?shù)?,以確保數(shù)據(jù)能夠準確無誤地轉移到LIMS系統(tǒng)合適的數(shù)據(jù)表中。
儀器接口的類型
實驗室中儀器與LIMS的接口種類繁多,但是從接口的模式來看,大致可分為以下幾種:LIMS與儀器工作站的雙向傳輸;LIMS與儀器工作站的單向傳輸;LIMS與無工作站儀器的單向傳輸。
基于儀器文件的儀器集成與LIMS的集成的實現(xiàn)
對于可與LIMS連接實現(xiàn)LIMS與儀器工作站的雙向傳輸和單向傳輸?shù)膬x器,LIMS是從存儲在本地硬盤或者網絡硬盤上的儀器產生的數(shù)據(jù)文件中提取數(shù)據(jù),并把提取到的有用數(shù)據(jù)映射到LIMS中。該儀器可以沒有連接到工作站但是它必需把它的數(shù)據(jù)輸送到一個LIMS可以訪問的地方。
儀器獲取數(shù)據(jù)的過程如下:
1)從儀器獲取數(shù)據(jù)到LIMS管理系統(tǒng)應用。把儀器文件存儲到指定的目錄下,LIMS會定期掃描該文件夾。
2)從儀器數(shù)據(jù)中提取信息,根據(jù)設定的解析腳本,LIMS提取儀器文件數(shù)據(jù)。
3)使用提取的儀器數(shù)據(jù)。根據(jù)預先定義好的映射腳本,LIMS把提取出來的數(shù)據(jù)映射到相關樣品的結果中。
從儀器數(shù)據(jù)中提取信息。根據(jù)在儀器屬性里面定義好的的解析腳本,LIMS提取儀器文件數(shù)據(jù)里面的相關信息。所謂解析腳本(Parsing Seript)就是一種允許你從儀器文件提取或者解析各種信息的儀器控制腳本,解析腳本可應用于各種格式的儀器數(shù)據(jù)并可應用于“實時”,例如當數(shù)據(jù)接收時??梢赃@樣理解解析腳本這個概念:解析腳本就是一系列的導航,指引LIMS如何讀取數(shù)據(jù)文件,即引導LIMS去“忽略”文件中大多數(shù)的內容而僅僅“記住”規(guī)定的項目。這些導航是由一系列需要設定參數(shù)的命令組成。
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